L'expertise de la BFH-HAFL se situe dans l'évaluation de la durabilité des systèmes alimentaires, de la production à la consommation. L'institut développe des solutions et des bases de décision pour une économie alimentaire plus durable au niveau des produits, des processus et des systèmes. Celles-ci se basent sur des analyses et des évaluations qualitatives et quantitatives de la durabilité. La BFH-HAFL se concentre sur l'évaluation de la dimension écologique et sociale de la durabilité.